2024. február 28., szerda

2024. február 27., kedd

2024. február 23., péntek

Bioinformatika alapjai

Ismeretterjesztő, rövid előadás az ELTE TTK bioinformatikusától:

Lesz e a Coli-ból szuperbaktérium?


https://youtu.be/iBJRLNDk39c?feature=shared


Frissítés:

Kettőnél több nukleotid szekvencia összehasonlítása az NCBI BLAST-tal:


https://youtu.be/A-DPU5xxyHs?feature=shared

2024. február 20., kedd

2024. február 19., hétfő

Bioinformatika alapjai, fakultáció, 20240220

Blast (Basic Local Alignment Search Tool), folytatás.

blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

Válasszuk ki: nucleotide blast

Align two or more sequences

Felső szövegdoboz:
NM_001134944.2

Alsó szövegdoboz:
NM_021669.2
NM_001009721.3
NM_001003052.2

2024. február 13., kedd

Biológia szakkör 1 (frissítve)

Kromoszómák és genomok.

Kromoszóma: a sejtmagban található, DNS és fehérje alkotja. A sejtmagi genetikai információt tartalmazza, az összes sejtmagi DNS-t, nemcsak a géneket.. Számuk a fajra jellemző, például ember esetében 23 db a haploid (n) kromoszóma-szám. Sejtosztódáskor figyelhető meg. A kromoszómák festődő fehérje-része a kromatin.

Genom: az összes örökítőanyaga, genetikai információja az adott sejtnek, nemcsak a géneket. Beletartoznak a sejtmagi kromoszómák, a mitokondriumban és a zöld színtestben található DNS is, baktériumok esetében a plazmidok is.

Ezen a honlapon tudunk kromoszómákat keresni:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/





Mus musculus


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/taxonomy/10090/ 

Escherichia coli

Homo sapiens

Bioinformatika alapjai, fakultáció, órai feladatok

Sziasztok! Akinek van kedve, gyakorolhatja otthon a teljes genom összehasonlítást egér genomokkal is:

https://www.youtube.com/watch?v=_TA86Tu1N0c

Ez pedig a BLAST fehérje és a mitokondrium-szekvencia órai feladataink részletes leírása és megoldása angolul:

https://guides.lib.berkeley.edu/ncbi/blast


2024. február 12., hétfő

Bionformatika alapjai, fakultáció 20240213

NCBI

Nyissuk meg a következő linket:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/


Írjuk be:

Escherichia coli


Vagy nyissuk meg a következő linket:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/taxonomy/562/ 


Mus musculus


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/taxonomy/10090/ 


Homo sapiens

2024. február 5., hétfő

Fehérjeszintézis, kodon szótár

A fehérjeszintézis és a kodon szótár megértéséhez egy kis segítség:


Magyar nyelvű videó:

https://youtu.be/HrDbFPmrb6A?feature=shared 


Angol nyelvű videó, magyar nyelvű felirat beállítható:

https://youtu.be/LsEYgwuP6ko?feature=shared 


A teljes lejátszási lista, RNS-DNS összhasonlítás, DNS megkettőződése, fehérjeszintézis:

https://youtube.com/playlist?list=PLwL0Myd7Dk1HK8gH2XIafNgQJD1dMX2aW&feature=shared 



5. lecke: Anyagszállítás

A szív üregei emberi szív maketten (2:09-től) és disznószívben (5:45-től) (magyar nyelvű):

https://youtu.be/IoXdmpWzios?feature=shared

Emberi szív boncolása és a szívroham (szívinfarktus) kialakulása (angol nyelvű):
https://youtu.be/m0fiHGlqivo?feature=shared