2024. február 19., hétfő

Bioinformatika alapjai, fakultáció, 20240220

Blast (Basic Local Alignment Search Tool), folytatás.

blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

Válasszuk ki: nucleotide blast

Align two or more sequences

Felső szövegdoboz:
NM_001134944.2

Alsó szövegdoboz:
NM_021669.2
NM_001009721.3
NM_001003052.2


Válasszuk ki:
Optimize for
More dissimilar...

Blast

Válasszuk ki:
Alignments
Pairwise comparison with dots



Törzsfa készítése:

Distance tree results



Egy gén megismerése és a szekvenciák letöltése:


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene


Írjuk be: Ghrelin

Keressük meg a Homo sapiens találatot.

Kattintsunk a FASTA-ra.

Több szekvencia letöltése egyszerre:

Pipáljunk ki több találatot.

 


Válasszuk a FASTA (text) lehetőséget.

Genetikai betegségek

Keressünk meg egy gént a NCBI-on:
human phenylalanine hydroxylase


Ctrl+f: MIM

OMIM adatbázis





Ensemble adatbázis